馬來西亞理科大學優勢專業涵蓋了藥劑與藥理學、教育與培訓、建筑與建造環境、化學工程、土木工程、商業與管理研究、電子電氣工程等專業，在2023QS學科排名當中，這幾類專業均躋身世界前200！馬來西亞理科大學在最新的QS世界大學排名榜當中，也成功趕超博特拉大學，QS排名137位，馬來西亞排名第二，與國內的雙一流名校中國科學技術大學排名相當！
馬來西亞理科大學優勢專業
馬來西亞理科大學USM在54類細分學科中有24類優勢學科排名進入TOP300。USM的學科建設發展均衡，24類優勢學科全面涉及五大學術領域。藥劑與藥理學、教育與培訓進入QS學科排名前100名，化學工程等9類學科進入第101-200名，社會科學與管理學等13類學科進入第201-300名。
優勢專業（2023QS學科排名）：
藥劑與藥理學：#全球第87
教育與培訓：#全球第97
建筑與建造環境：#全球第101-150
化學工程：#全球第101-150
土木工程：#全球第151-200
商業與管理研究：#全球第151-200
傳媒學：#全球第151-200
電子電氣工程：#全球第151-200
統計與運籌學：#全球第151-200
馬來西亞理科大學本科專業
計算機：軟件工程、信息工程系統技術、多媒體處理、網絡處理智能系統分布式計算機系統與安全；
會計：會計；
純理科：物理學、化學、數學、生物學（微生物、植物病理學、動物解剖學）；
技術類：食品技術、環境技術、紙張及包裝技術、生物資源；
應用科學：地球物理、工程物理、醫學物理、應用物理、分析化學、工業化學、操作研究、計算機模擬、數學模擬、數學與經濟、應用統計學、生物技術、農業生物、海洋生物、環境生物、植物病
理學、傳染媒介與寄生物管理；
房屋、建筑及規劃：建筑管理、建筑技術、城市地區規劃、建筑學、室內設計、測量；
管理學：組織行為、市場學、操作管理、國際商務、金融；
人文科學：英語語言學、馬來語學、地理學、文學、歷史、文科（翻譯與口譯）大眾傳媒、熒屏研究、誘勸性傳媒、新聞學；
教育學：學科教育；
社會科學：人類學和社會學、經濟學、社會工作、規劃和管理發展、政治學；
藝術類：音樂、設計和新媒體技術、產品設計、圖像傳媒、美術、演繹與引導，馬來語授課；
馬來西亞理科大學碩士專業
馬來西亞理科大學碩士專業分為混合型碩士專業和授課型碩士專業。具體的專業信息如下：
D MODE混合型：理碩士：原料工程、數學、統計、化學儀器、地理信息科學、旅游發展、綜合醫學、醫學研究、環境工程、建筑工程、電子系統設計工程、輸血科學、臨床解剖學、醫療統計學、醫科教育學。文碩士：馬來語、文學、傳媒、翻譯員和英語研究、翻譯學
SEWORK MODE授課型：理碩士：計算機科學、信息科技、固體形態物理學、醫學物理、企業管理、設計、建筑科技住宅學、建筑環境、旅游發展、電子系統設計工程、運動學、數學教學。傳媒碩士：電影研究、新聞環境研究；工商管理碩士MBA，學費5.6萬人民幣；公共關系碩士、經濟管理碩士、藥劑學碩士（臨床藥劑學）、多媒體教育學碩士；教育碩士：課程研究、教育經營與管理、心理測試與教育評估、教育科學、英語教育/第二英語教學、教學技術、教育心理學、（對個人，社會以及心理等問題的）咨詢/指導。
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