馬來西亞理科大學開設專業涵蓋了本科、碩士和博士學位課程，其中本科專業涵蓋了計算機、會計、理科、應用科學、管理學、人文科學、教育學、社會科學等，碩士專業涵蓋了公共關系碩士、經濟管理碩士、藥劑學碩士、工商管理碩士、多媒體教育學碩士、教育碩士等，博士專業涵蓋了理學、應用文學、工程等領域，馬來西亞理科大學專業廣泛，課程豐富，給予學生更多專業選擇機會。
馬來西亞理科大學本科開設專業
1、計算機：軟件工程 信息工程系統技術 多媒體處理 網絡處理 智能系統分布式計算機系統與安全
2、會計：會計
3、純理科：物理學 化學 數學 生物學（微生物、植物病理學、動物解剖學）
4、技術類：食品技術 環境技術 紙張及包裝技術 生物資源
5、應用科學；地球物理 工程物理 醫學物理 應用物理 分析化學 工業化學 操作研究 計算機模擬 數學模擬 數學與經濟 應用統計學 生物技術 農業生物 海洋生物 環境生物 植物病理學 傳染媒介與寄生物管理
6、房屋、建筑及規劃：建筑管理 建筑技術 城市地區規劃 建筑學 室內設計 測量
7、管理學：組織行為 市場學 操作管理 國際商務 金融
8、人文科學：英語語言學 馬來語學 地理學 文學 歷史 文科（翻譯與口譯）大眾傳媒 熒屏研究 誘勸性傳媒 新聞學
9、教育學：學科教育
10、社會科學：人類學和社會學 經濟學 社會工作 規劃和管理發展 政治學
11、藝術類：音樂 設計和新媒體技術 產品設計 圖像傳媒 美術 演繹與引導
馬來西亞理科大學碩士開設專業
1、MIXED MODE混合型：理碩士：原料工程、數學、統計、化學儀器、地理信息科學、旅游發展、綜合醫學、醫學研究、環境工程、建筑工程、電子系統設計工程、輸血科學、臨床解剖學、醫療統計學、醫科教育學。
文碩士：馬來語、文學、傳媒、翻譯員和英語研究、翻譯學
2、COURSEWORK MODE授課型：理碩士：計算機科學、信息科技、固體形態物理學、醫學物理、企業管理、設計、建筑科技
住宅學、建筑環境、旅游發展、電子系統設計工程、運動學、數學教學。
傳媒碩士：電影研究、新聞環境研究
工商管理碩士MBA，學費5.6萬人民幣
公共關系碩士
經濟管理碩士
藥劑學碩士（臨床藥劑學）
多媒體教育學碩士
教育碩士：課程研究、教育經營與管理、心理測試與教育評估、教育科學、英語教育/第二英語教學、教學技術、教育心理學、（對個人,社會以及心理等問題的）咨詢/指導。
馬來西亞理科大學博士開設專業
理學：數學、微生物學、海洋科學、應用昆蟲學、應用寄生蟲學、水生生物學、生物技術、植物學、化學、環境生物學、環境科學、分子生物學、物理學、植物病理學、統計學、動物學。
應用理學：可持續發展、建筑測量、生物化學分析、環境技術、食品技術、制藥科學、社會與管理藥學、藥物化學、制藥技術、生理學、藥理學、數量測量、室內設計、項目管理、計算機科學、藥學、藥劑學、光電子學、臨床藥學、生物過程技術、生物資源、建筑學、建筑技術。
工程：航空航天工程、化學工程、土木工程、電氣與電子工程、材料工程、機械工程、微電子系統工程、礦產資源工程、聚合物工程、河流與城市排水工程。
應用文學：教育、會計、傳媒、戲劇、教育技術、金融、藝術、性別研究、管理、音樂、可持續發展、英語語言研究、文學、哲學。
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